MATLAB中HMM函数SEQ（观察序列的值）必须是正整数吗

1. MATLAB中HMM函数SEQ（观察序列的值）必须是正整数吗

O应该就是观察值的数据，data数据应该只能在1~O内变换，超过就会报错。有199个观察值时混淆矩阵自然是5*199（5为状态数），没啥矛盾的。
不知道你说的矛盾在哪！
如果数据是你最后描述的那样，我觉得可以用混合高斯隐马尔科夫模型来训练，而不是用离散的，因为离散的隐马尔科夫观察值太多，而中间有很多的观察值基本不会出现在数据里，对估算结果肯定会有影响。

2. 进行HMM训练的样本问题

我也不太懂啊 程序应该没问题的 ，观察状态应该就是B二维数组范围的正整数，其实也就是个符号，状态1。 状态2。状态3。。。。。。每个状态的具体代表什么，可以自己定义的，比如从荷叶推断天气时，状态1 荷叶很干 
状态2  荷叶干 状态3 荷叶湿润， 状态4荷叶很湿。。。。等等  根据自己需求定义即可。。不知道说的对不对，建议去看 随机过程 里面讲了HMM模型。

3. 请问，matlab中HMM工具箱里，hmmestimate函数用的什么估计方法？

最大似然估计

4. Matlab使用HMM Toolbox(隐马尔可夫模型工具箱)问题

HMM工具箱  是个函数库，运用它分类需要编写主程序，并应用其中的函数。其中工具有几个DEMO，简单的举例的函数库的应用。

5. HMM工具箱有多观测样本序列问题的训练算法程序吗？注意是多观测样本序列，不是多样本序列。

我最近也在找这个，这个叫MOHMM（multiple-observations HMMs），如果找到我发你邮箱。

6. 请教关于MATLAB语言的HMM工具箱的使用问题

　　我学它的时候老师讲HMM主要解决三个问题类型，评估问题，解码问题和机械学习。em（BW)算法用于解决第三个问题类型，用观测数据来训练模型参数。用哪个function得看你作业是属于哪种类型。而且要看你的模型是哪种，单纯的left to right模型的话状态转移矩阵中只保存相同状态的转移概率和对下一个状态的转移概率，其他的都是0。建议用kevin murphy的HMM工具箱，它应该是世界上使用率最高最有名的。

7. HMM 多序列训练问题

我在多序列HMM训练中也遇到了相同的问题， 但是不太普遍，如11个检测序列可能其中会有3-4个左右出现概率为0的情况，个人感觉这种情况是由于训练时阈值选取不当造成的。我在训练时是通过每次参数刷新后计算前后两次前向概率并求查，随着循环的继续，差值会继续减小直到达到阈值时循环结束， 当阈值选取较小时（我的阈值为0.01）循环次数较多，最终得到的最优参数（A ，B，pi）中A B矩阵中会有许多0出现，而在计算前向概率时通过迭代公式计算scale[t]时但凡有一项是0得到的结果即为0。 个人感觉解决方法主要还要通过调整阈值与增加序列个数来实现。

8. 如何利用matlab搭建hmm模型

我也不太懂啊 程序应该没问题的 ，观察状态应该就是B二维数组范围的正整数，其实也就是个符号，状态1。 状态2。状态3。。。。。。每个状态的具体代表什么，可以自己定义的，比如从荷叶推断天气时，状态1 荷叶很干  状态2  荷叶干 状态3 荷叶湿润， 状态4荷叶很湿。。。。等等  根据自己需求定义即可。。不知道说的对不对，建议去看 随机过程 里面讲了HMM模型。