三份猴痘病毒最新基因测序结果公布,其中哪些信息值得关注?

2024-05-15 14:13

1. 三份猴痘病毒最新基因测序结果公布,其中哪些信息值得关注?

来自葡萄牙、比利时、美国的三个研究小组分别公布在全球多地暴发的猴痘(Monkeypox)疫情中感染者所携带病毒基因组序列的初步结果。
猴痘病毒最新基因测序结果公布,哪些信息值得关注感染猴痘的人通常在感染后7到14天开始出现症状,病情通常会持续几个星期。世界卫生组织和美国疾病控制与预防中心都宣称,“尽管大多数人能从病毒中康复,但在某些情况下,它可能是危险的,甚至可以致命。”

葡萄牙国家卫生研究所的约翰.保罗.戈麦斯(Jo o Paulo Gomes)及其同事在(https://virological.org)网站上,以论文形式公布了团队5月4日对一名葡萄牙男性患者携带的猴痘病毒的基因组测序草案(PT0001)。这也是近期全球多地暴发猴痘疫情以来,第一份猴痘病毒最新基因组的测序结果。
团队用QIAamp DNA血液试剂盒(Qiagen)从患者皮肤渗出样品中提取出猴痘病毒的DNA,使用快速条形码测序试剂盒(SQK-RBK004),在Oxford Nanopore MinION平台上对病毒基因组进行了鸟枪法宏基因组测序。整个基因组的平均覆盖深度约为7倍。(覆盖深度,亦称测序深度,指每个碱基被测序的平均次数,即测序的数据总量与基因组大小的比值)随后,团队利用INSaFLU在线平台,将多个短基因片段(reads)映射到一个相关的参考基因组序列上(MN648051.1),并手动检查基因组序列以验证变异位置。公布的基因组草图序列覆盖了92%的参考序列。

葡萄牙团队公布的基因进化树分析草案基于对包括52个猴痘病毒基因序列的核心比对(在137 668 bp长度的基因序列中比对了955个变异位置)根据这篇论文,基因进化树分析草案显示,分离出来的病毒与2018年和2019年从尼日利亚传播到英国、以色列和新加坡的病毒有密切关系。论文作者表示,一旦获得高深度的Illumina数据(测序还在进行中),病毒基因组序列将被进一步呈现。

现在已经得到充分研究的新冠病毒,也很难将特定的突变与病毒传播能力等方面的变化联系起来。猴痘病毒有一个庞大的基因组——大约有20万个碱基对,而冠状病毒只有3万个碱基对——目前科学家们并没有那么深入的研究。

三份猴痘病毒最新基因测序结果公布,其中哪些信息值得关注?

2. 三份猴痘病毒最新基因测序结果公布,其中有哪些信息值得关注?

来自葡萄牙、比利时和美国的研究小组公布了世界许多地区最近爆发的猴痘病毒感染者携带病毒基因组序列的初步结果。三种猴痘病毒的DNA序列初步呈现出同源性,均属于西非温和毒株,与三年前在英国、新加坡和以色列发现的猴痘病毒密切相关。人类感染猴痘的最初症状包括发烧、头痛、肌肉酸痛、淋巴结肿大、寒战和疲劳。发热后1-3天出现皮疹,开始为斑丘疹,很快变成疱疹,形成小脓疱,局部淋巴结肿大;最终结痂形成并脱落。皮疹通常从面部开始,然后扩散到四肢。皮疹也可能出现在口腔和生殖器上,但也可能从身体的其他部位开始。 

猴水痘通常是自限性的,但它可能对特殊人群造成严重后果,例如儿童、孕妇或因其他疾病而免疫力受到抑制的人。猴痘病毒的突变使其具有高度传染性,这或许可以解释此次疫情的爆发。有些人怀疑性传播可能是途径,体液和亲密接触,但没有理由怀疑。它也可以通过疫苗接种或通过胎盘垂直传播。猴痘病毒可以人传人,但传染性有限。考虑到大背景下的谨慎行事,感染者仍然需要被隔离。而变异后的猴痘病毒与我们想象中的传染性和传播性相比,显然已经有了质的改变,需要引起警觉,从西方国家开始购买天花疫苗的数量可以预见一二。

本次暴发的猴水痘病毒与上一次相比,共有94个核苷酸变化和51个氨基酸变化。对于稳定的DNA 病毒来说,这是一个非常高的突变率, 西非进化枝的病死率很低,不到1% 从这个角度来看,这次引发疫情的病毒是西非进化枝,也算是有点让人放心了。啮齿动物和灵长类动物都可以携带猴痘病毒。一般而言,动物与人之间的传播可通过直接接触血液、体液或受感染动物的皮肤或粘膜破损而发生。人与人之间的传播是由密切接触呼吸道分泌物、感染者的皮肤损伤或最近被污染的物体引起的,通常需要呼吸道飞沫进行长时间的近距离接触。 

在非流行国家已发现大量猴痘患者,且病例无直接到流行地区旅行史,应先排查疫情传播途径,排查所有可能的传播途径.如果我们明白这一点,我们就能更好地控制疫情。 

3. 猴痘病毒最新基因测序公布,与三年前英国毒株相近,还有哪些特点?

       近期在英国、美国、加拿大、葡萄牙、西班牙等欧美国家发现的猴痘确诊病例,引起了全世界不少国家和地区的关注。近期在全球多地发现的猴痘确诊患者中携带的病毒基因组序列的初步结果中可以得知:这一个猴痘病毒的毒株是比较温和的西非分支。据悉,西非分支的致死率较低,致死率一般是在1%左右,相比于刚果盆地分支来说,确实是比较温和,可以在以往的数据中得出刚果盆地分支的致死率可以高达10%。

       目前在英国、美国、加拿大、葡萄牙、西班牙等欧美国家发现的猴痘确诊病例还有其他的一些特点。比如,英国报告的猴痘疫情目前已经出现了社区传播的现象。在英国现在每天都会发现没有跨境到西非旅行的记录,但是相关的卫生官员们预计接下来的一段时间之内会出现明显增加的确诊人数。因为在目前的阶段,一般认为猴痘的传播有两大可能:跨境旅行接触到被感染的动物或者是跨境的动物贩卖。

       另外还有一个特点,就是在英国、美国、加拿大、葡萄牙、西班牙等欧美国家发现的猴痘确诊病例中,很大一部分是同性恋和双性恋男性,所以相关卫生官员认为这根他们进行密切接触的方式有关,并且以此为途径在人群中进行传播。

       根据世界卫生组织的数据显示,天花疫苗对猴痘病毒的有效性高达85%,故此,从猴痘的传播方式上来看,有关的国家就建议,与猴痘确诊患者有过接触的人群,建议接种天花疫苗。这也是猴痘疫情出现地区中的人们防范猴痘病毒的一种有效措施。

猴痘病毒最新基因测序公布,与三年前英国毒株相近,还有哪些特点?

4. 基因测序证实猴痘已大规模社区传播,这意味着什么?

按照我们目前防新冠的方法,防猴痘是根本不愁的,但是得防止境外投毒,利用包裹、候鸟、人体投毒,我们要吸取教训,不能让华亭宾馆的事件再次重演。魔都沦陷一次就够了,不能无止境地沦陷在生物战中。

猴痘这种病很好管控的,接触传播和空气传播,传播能力远不如新冠但是不排除被改造过之后传播能力起飞。当前我们防新冠的措施已经很齐全了,防不住的只有那些喜欢共存的、呼吸自由的国家。猴痘先是以发热肌痛乏力等为主要症状,患者没力气乱跑。不像新冠得了之后还能逛街投毒。其次猴痘最具特征性的是以皮疹为主要临床表现,最早的症状出现在舌头和口腔粘膜,得没得,伸伸舌头,看一眼皮肤就行了,不像新冠,还要搞一堆核酸检测,测了不过瘾还得测抗原。



这个过程会持续 2-3 周。疾病的严重程度可能取决于个体的初始健康状况、接触途径和感染病毒的毒株(西非与中非病毒基因组或进化枝)。西非猴痘与较轻的疾病、较少的死亡和有限的人际传播有关。与西非病毒进化枝相比,中非猴痘病毒进化枝的人类感染通常更严重,死亡率更高。中非猴痘病毒的人际传播已得到充分证明。

从疑似猴痘病毒感染的人和动物身上采集的样本应由在配备适当设备的实验室中工作的训练有素的工作人员处理。必须根据世卫组织关于传染性物质运输的指导意见,安全地准备病人标本,以便使用三重包装运输。监测和快速发现新病例对于遏制疫情至关重要。在人类猴痘暴发期间,与感染者密切接触是猴痘病毒感染的最重要危险因素。卫生工作者和家庭成员感染的风险更大。医护疑似或确诊猴痘病毒感染患者或处理猴痘病毒标本的卫生工作者应采取标准的感染控制预防措施。如果可能,应选择以前接种过天花疫苗的人来照顾患者。

5. 媒体报道:基因测序证实猴痘已在欧洲大规模社区传播,这意味着什么?

按照我们目前防新冠的方法,防猴痘是根本不愁的,但是得防止境外投毒,利用包裹、候鸟、人体投毒,我们要吸取教训,不能让华亭宾馆的事件再次重演。魔都沦陷一次就够了,不能无止境地沦陷在生物战中。
把新冠和猴痘的事件串在一起,不免体会到我们大佬们的深谋远虑,新冠难道只是一场练兵,因为还有更恐怖的生武来袭吗?



猴痘这种病很好管控的,接触传播和空气传播,传播能力远不如新冠。但是不排除被改造过之后传播能力起飞。当前我们防新冠的措施已经很齐全了,防不住的只有那些喜欢共存的、呼吸自由的国家。
猴痘先是以发热肌痛乏力等为主要症状,患者没力气乱跑。不像新冠得了之后还能逛街投毒。其次猴痘最具特征性的是以皮疹为主要临床表现,最早的症状出现在舌头和口腔粘膜,得没得,伸伸舌头,看一眼皮肤就行了,不像新冠,还要搞一堆核酸检测,测了不过瘾还得测抗原。

感染后有一个潜伏期,平均持续7-14天。初始症状(例如发烧、不适、头痛、虚弱等)的发展标志着前驱期的开始。
区分猴痘感染和天花感染的一个特征是淋巴结肿大(淋巴结病)。淋巴结肿大可能是全身性的(涉及身体上的许多不同部位)或局限于几个区域(例如颈部和腋窝)。
前驱症状后1-3天,会出现皮疹。病变通常开始同时发展并在身体的任何特定部位一起发展。在结痂和消退之前,病变的演变经历了四个阶段——黄斑、丘疹、水泡、脓疱。

这个过程会持续 2-3 周。疾病的严重程度可能取决于个体的初始健康状况、接触途径和感染病毒的毒株(西非与中非病毒基因组或进化枝)。西非猴痘与较轻的疾病、较少的死亡和有限的人际传播有关。与西非病毒进化枝相比,中非猴痘病毒进化枝的人类感染通常更严重,死亡率更高。中非猴痘病毒的人际传播已得到充分证明。

媒体报道:基因测序证实猴痘已在欧洲大规模社区传播,这意味着什么?

6. 多国报告猴痘病毒确诊病例,科学家对这种病毒现在有何了解?

世界卫生组织数据显示,截至5月21日,12个非猴痘流行国家已报告92例猴痘确诊病例和28例疑似病例,全球猴痘病例可能进一步增加。包括英国、西班牙、葡萄牙、德国、意大利、美国、加拿大、澳大利亚、比利时、以色列等在内的多国相继报告猴痘病例。世卫组织指出:“现有信息表明,人与人之间的传播,正发生在与有猴痘症状病例有密切身体接触的人之间。”

症状与后果世卫组织网站19日更新资料显示,猴痘病毒感染症状与天花相似,但临床严重程度较轻。潜伏期通常为6至13天,可能长达21天。发病初期症状包括发热、头痛、淋巴结肿大、肌肉酸痛、重度疲乏等。发热几天后发展为面部和身体其他部位大面积皮疹,并可能导致继发性感染、支气管肺炎、败血症等。

猴痘通常是一种自限性疾病,多数患者会在几周内康复。重症常见于儿童或免疫缺陷者,还与感染者基础健康状况等有关。世卫组织信息显示,猴痘病死率历来在普通人群中为 0% 至 11%。

传播与预防直接接触受感染动物的血液、体液、皮肤或黏膜损伤部位等,可能导致猴痘病毒从动物传播给人类。食用烹饪不当的感染动物也是“动物传人”的风险因素。

一般来说,猴痘病毒在人际间传播并不常见。世卫组织资料显示,猴痘的人际传播途径包括密切接触感染者的呼吸道分泌物、皮肤损伤部位或被污染物品等。呼吸道飞沫传播的发生需要长时间的面对面接触。此外,猴痘病毒可能经由胎盘或生产期间的密切接触发生母婴传播。研究表明,接种天花疫苗预防猴痘有效率达85%。