单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna

1. 单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna

单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna
单细胞全基因组测序技术是在单细胞水平对全基因组进行扩增与测序的一项新技术。其原理是将分离的单个细胞的微量全基因组DNA进行扩增，获得高覆盖率的完整的基因组后进行高通量测序用于揭示细胞群体差异和细胞进化关系

2. 常规转录组测序和数字基因表达谱测序（RNA-seq）有什么不同？初接触，很多不懂。。

基本目的是类似的。不同之处在于测序的模板序列，前者是直接随机测序cDNA库，后者是先把模板按照一定方法打断（例如酶切或其他），只从打断位置开始测序，测序片段短，但相应深度更高。
如果你已经有参考基因组，使用所谓“表达谱”测序是可以的。此外，表达谱方法更便宜，但个人觉得适用性不如转录组广泛，可做的分析有限。

3. 请问是不是所有生物都有DNA和RNA，只是遗传物质有的DNA，有的RNA

不是的
高等生物一般都有dna和rna，二者共同构成遗传物质，其中dna是主要遗传物质。
除了部分病毒的遗传物质是rna外，其余的病毒以及全部具典型细胞结构的生物的遗传物质都是dna，只要有dna，就以dna为遗传物质。
简单来说：
这种生物如果它既有dna又有rna，那么它的遗传物质是dna,
如果这种生物只有dna,那么dna是它的遗传物质。
如果它只有rna，rna才是它的遗传物质。

4. 做全基因组测序前，需要检测dna浓度和纯度吗

做全基因组测序前，需要检测dna浓度和纯度
宏基因组是指特定环境中全部生物（微生物）遗传物质的总和。宏基因组测序是利用高通量测序技术对环境样品中全部微生物的基因组进行测定，以获得单个样品的饱和数据量，可进行微生物群体的基因组成及功能注释，微生物群体的物种分类，多样性分析，群落结构分析，样品间的物种或基因差异以及物种间的代谢网络研究，探索微生物与环境及宿主之间的关系，发掘和研究新的具有特定功能的基因等。与传统方法相比，基于高通量测序的宏基因组研究无需构建克隆文库，这避免了文库构建过程中利用宿主菌对样品进行克隆而引起的系统偏差，简化了实验操作，提高了测序效率。此外，宏基因组测序研究摆脱了微生物分离纯培养的限制，扩展了微生物资源的利用空间，为环境微生物群落的研究提供了有效工具。通过宏基因组深度测序可以揭示或估计环境中真实的物种多样性和遗传多样性，挖掘具有应用价值的基因资源，应用于开发新的微生物活性物质，为研究和开发新的微生物活性物质提供有力支持。

5. 测序后的DNA序列与预测的有几个碱基不同，如何解决

测序后的DNA序列与预测的有几个碱基不同
DNA测序（DNA sequencing）作为一种重要的实验技术，在生物学研究中有着广泛的应用。早在DNA双螺旋结构（Watson and Crick,1953)被发现后不久就有人报道过DNA测序技术，但是当时的操作流程复杂，没能形成规模。随后在1977年Sanger发明了具有里程碑意义的末端终止测序法，同年A.M.Maxam和W.Gilbert发明了化学降解法。Sanger法因为既简便又快速，并经过后续的不断改良，成为了迄今为止DNA测序的主流。然而随着科学的发展，传统的Sanger测序已经不能完全满足研究的需要，对模式生物进行基因组重测序以及对一些非模式生物的基因组测序，都需要费用更低、通量更高、速度更快的测序技术，第二代测序技术（Next-generation sequencing)应运而生。这三个技术平台各有优点，454 FLX的测序片段比较长，高质量的读长（read）能达到400bp；Solexa测序性价比最高，不仅机器的售价比其他两种低，而且运行成本也低，在数据量相同的情况下，成本只有454测序的1/10；SOLID测序的准确度高，原始碱基数据的准确度大于99.94%，而在15X覆盖率时的准确度可以达到99.999%，是目前第二代测序技术中准确度最高的。虽然第二代测序技术的工作一般都由专业的商业公司来完成，但是了解测序原理、操作流程等会对后续的数据分析有很重要的作用，下文将以Illumina/Solexa Genome Analyzer 测序为例，简述第二代测序技术的基本原理、操作流程等方面。

6. 测序结果如何区分常非编码RNA与mRNA

非编码RNA（Non-coding RNA）是指不编码蛋白质的RNA。其中包括rRNA，tRNA，snRNA，snoRNA 和microRNA 等多种已知功能的 RNA，还包括未知功能的RNA。这些RNA的共同特点是都能从基因组上转录而来，但是不翻译成蛋白。非编码RNA 从长度上来划分可以分为3类：小于50 nt；50 nt到500 nt；大于500 nt。细胞中含量最高的是rRNA 和tRNA 这两种常见的非编码RNA。
而mRNA是由DNA的一条链作为模板转录而来的、携带遗传信息的能指导蛋白质合成的一类单链核糖核酸。
所以说最大的区别在于其序列可不可以编码蛋白质。
同时，如果是原核生物的mRNA 一般有TATAbox的保守序列，如果是真核生物一般－25到－30有TATAbox，-75有CAATbox，再上游有GCbox。这些都是区分mRNA 与非编码RNA的特征。
不过这些工作都需要研究人员通过相应的比对工具逐条筛选和比对，推荐GenBank 数据库，网址是http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/
上面有许多专业的在线分析工具包和全球范围上传的数据可供参考。

7. 怎么检测 RNA里混有基因组DNA

这个如果你做反转录的话，只能是用PCR检测了。电泳基本检测不出来。象现在的试剂盒或者TRIZOL提的RNA，除质量太差，一般含基因组很少。 如果RT－PCR发现结果不对，可以用那种不含RNA酶的DNA酶处理一下。 如果引物能避开的话，有点DNA也没关系。
转录组学的研究对象包括mRNA和非编码RNA等。新一代高通量测序技术可以全面快速地获得特定细胞或组织在某一个状态下几乎所有转录本的序列信息和表达信息，从而准确地分析基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记（SNPs或SSR）等生命科学的重要问题。  基因表达谱测序是直接对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序，可以用来研究基因的表达差异情况。该技术结合了转录组测序建库的实验方法，与转录组测序相比，基因表达谱测序要求的读长更短，测序通量更小，但仅可用于基因表达差异的研究。  转录组测序是RNA水平测序，相当于DNA水平的基因组测序，是一个框架。表达谱主要研究的是基因表达量的变化，上调或下降。先要有转录组或是基因组才可以做表达谱，否则没有Ref做参考。  转录组测序和表达谱测序其实都是通过高通量测序技术进行的，转录组测序主要是针对没有参考基因组（即基因组未完成测序）的物种，侧重于获得你材料的全部转录组信息；而表达谱则侧重于检测各个基因的表达量。

8. 已知DNA的序列为:

问题A： DNA的复制方向是5‘到3’（新链）。 若以C链为模板，则沿着复制叉的方向，刚好新链是5‘到3’，所以C链合成的是先导链。而若以W链为模板，则是3‘到5'，以形成冈崎片段的方式合成新链。故W链合成的是后滞链。
问题B：合成DNA，一般用PCR。已经有W作为模板，那么，要加入 引物，DNA聚合酶（Taq酶）， 原料 dNTP 、Mg2+等
问题C：合成核酸时，以dNTP为原料，当dNTP加到多核甘酸链上时，dNTP的 β、ε磷酸基会以焦磷酸的形式脱下，并水解释放自由能推动反应进行。而α-磷酸基会与其他核苷酸的3’-OH 成磷酸酯键。多以应该标记dNTP的 α-磷酸基
问题D：转录的方向同样是5'到3‘。所以，按复制叉的方向，C链是模板链。
 
PS：楼主，这些基础的题目看下书就行，打字不累啊。